בה' בשבט תשע"ז (1 בפברואר 2017) פונה היישוב עמונה, התושבים פונו מבתיהם, בתי המשפחות ומבני הציבור נהרסו.

מספר חודשים לאחר הפינוי החלו עבודות להקמת ישוב חדש למפונים 'עמיחי' בגוש שילה.

ב-25 בדצמבר 2014, בעקבות עתירה לבג"ץ בדרישה להריסת הישוב כולו, פסק בג"ץ שיש להרוס את הישוב. ניסיונות רבים להסדרת הישוב מול הממשלה ולמציאת פתרונות שישאירו את הישוב לא צלחו.