הפרויקט המתמשך של בניית מערכות ביוב מתקדמות – נמצא בעיצומו. תושבי בנימין הרי משלמים כבר מזה למעלה משנה אגרת ביוב בשל כך, והכספים - מושקעים בבינוי ואחזקת מתקני טיהור השפכים - המט"שים – שעלותם במיליונים רבים מאד. בשלבי הקמה מתקדמת נמצאים המתקנים בעפרה, במכמש, בכוכב השחר וברימונים. העבודות בעיצומן גם במט"שים של טלמון ונריה, וכן בקווי סילוק השפכים מכפר אדומים, המתחברים ל"קו האוג" – קו הביוב שיורד מירושלים אל "מאגר האוג" בבקעה, שם עוברים המים תהליך טיהור להשקיה.
במהלך 2009 ייכנסו להילוך גבוה ארבעה פרויקטים נוספים, שיביאו פתרון לשפכי עטרת, נילי ונעלה, בית חורון, ומבוא חורון. כל זאת בהתאם לתכניות העבודה שהוכנו בעוד מועד.
משברי מים
שני משברי מים שפרצו לאחרונה הובאו לכדי פתרון: בנופי פרת התפוצץ קו של מקורות שגרם להפסקת מים במשך שלושה וחצי ימים. יום וחצי ארך התיקון על ידי מקורות, ועוד יומיים נדרשו לתקן את הנזק שגרם התיקון של מקורות. לאחר כל תיקון יש לשטוף את הקווים בטרם הפעלת המים לשימוש, מה שלא נעשה, וגרם לכניסת לכלוך רב למערכת המים היישובית, עד לסתימות ולקשיים רבים באספקת המים. המועצה נחלצה לבדיקת כל המערכת היישובית, ובסופו של דבר החליפה את כל מערכת פיקוד המים היישובית שניזוקה.
גם במצפה כרמים חוו התושבים משבר מים משלהם – בעיצומן של עבודות על הגדלת קוטר הקו המוביל מים למצפה כרמים, הסמוך לכוכב השחר, הסתבר שכתוצאה מקריסת המערכת הפנימית מים רבים הולכים לאיבוד. המערכת נבנתה לפני כשש שנים, ואיכותה היתה ירודה, מה שגרם לאובדני מים תת קרקעיים רבים, שהגיעו לסכומים גבוהים. לא רק עלויות המים החריגות העידו על כך, גם הפיצוצים בינות לקרואנים, ולחות האדמה וצבעה הירוק תמיד. מחלקת התברואה הבינה שאין ברירה אלא להחליף את כל מערכת חלוקת המים לקרוואנים, וכך נעשה.
המים שלנו
מלשכת הבריאות נפת רמלה, התקבל במועצה הדו"ח התקופתי על איכות מי השתיה בבנימין. מהדו"ח עולה כי בתקופה האחרונה נערכו בכל יישובי בנימין 262 דגימות מי שתיה, ומתוכן 100% נמצאו תקינות, כלומר איכות מי השתיה בהם ברמת התקן. הדגימות נלקחות על פי תכנית עבודה מסודרת מן הבריכות, המאגרים ורשתות המים היישוביות.